1. Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch
vụ chịu thuế GTGT được khấu trừ toàn bộ.
- Trường
hợp hàng hóa có hao hụt tự nhiên do tính chất lý hóa trong quá trình vận chuyển,
bơm rót như xăng, dầu… thì được kê khai, khấu trừ số thuế GTGT đầu vào của số
lượng hàng hóa thực tế hao hụt tự nhiên không vượt quá định mức hao hụt theo
quy định. Số thuế GTGT đầu vào của số lượng hàng hóa hao hụt vượt định mức
không được khấu trừ, hoàn thuế.
- Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ hình thành tài sản cố định là nhà ăn ca, nhà
nghỉ giữa ca, phòng thay quần áo, nhà để xe, nhà vệ sinh, bể nước phục vụ cho
người lao động trong khu vực sản xuất, kinh doanh và nhà ở, trạm y tế cho công
nhân làm việc trong các khu công nghiệp được khấu trừ toàn bộ.
2. Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ (kể cả tài sản cố định) sử dụng đồng thời
cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế GTGT thì
chỉ được khấu trừ số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ dùng cho sản xuất,
kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT. Cơ sở kinh doanh phải hạch toán
riêng thuế GTGT đầu vào được khấu trừ và không được khấu trừ; trường hợp không
hạch toán riêng được thì thuế đầu vào được khấu trừ tính theo tỷ lệ (%) giữa
doanh thu chịu thuế GTGT so với tổng doanh thu của hàng hóa, dịch vụ bán ra
không hạch toán riêng được.
Cơ sở
kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế GTGT hàng tháng tạm
phân bổ số thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ, tài sản cố định mua vào được khấu
trừ trong tháng, cuối năm cơ sở kinh doanh thực hiện tính phân bổ số thuế GTGT
đầu vào được khấu trừ của năm để kê khai điều chỉnh thuế GTGT đầu vào đã tạm
phân bổ khấu trừ theo tháng.
3. Thuế
GTGT đầu vào của tài sản cố định, máy móc, thiết bị, kể cả thuế GTGT đầu vào của
hoạt động đi thuê những tài sản, máy móc, thiết bị này và thuế GTGT đầu vào khác
liên quan đến tài sản, máy móc, thiết bị như bảo hành, sửa chữa trong các trường
hợp sau đây không được khấu trừ mà tính vào nguyên giá của tài sản cố định hoặc
chi phí được trừ theo quy định của Luật thuế thu nhập doanh nghiệp và các văn bản
hướng dẫn thi hành:
+ Tài sản
cố định chuyên dùng phục vụ sản xuất vũ khí, khí tài phục vụ quốc phòng, an
ninh; tài sản cố định, máy móc, thiết bị của các tổ chức tín dụng, doanh nghiệp
kinh doanh tái bảo hiểm, bảo hiểm nhân thọ, kinh doanh chứng khoán, cơ sở khám,
chữa bệnh, cơ sở đào tạo; tàu bay dân dụng, du thuyền không sử dụng cho mục đích
kinh doanh vận chuyển hàng hóa, hành khách, kinh doanh du lịch, khách sạn.
+ Tài sản
cố định là ô tô chở người từ 9 chỗ ngồi trở xuống (trừ ô tô sử dụng vào kinh
doanh vận chuyển hàng hóa, hành khách, kinh doanh du lịch, khách sạn) có trị
giá vượt trên 1,6 tỷ đồng (giá chưa có thuế GTGT) thì số thuế GTGT đầu vào
tương ứng với phần trị giá vượt trên 1,6 tỷ đồng không được khấu trừ.
4. Khấu
trừ thuế GTGT trong một số trường hợp cụ thể như sau:
- Đối với
cơ sở sản xuất kinh doanh tổ chức sản xuất khép kín, hạch toán tập trung có sử
dụng sản phẩm thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT qua các khâu để sản xuất ra
mặt hàng chịu thuế GTGT thì số thuế GTGT đầu vào tại các khâu được khấu trừ
toàn bộ.
- Đối với
cơ sở sản xuất kinh doanh có dự án đầu tư thực hiện đầu tư theo nhiều giai đoạn,
bao gồm cả cơ sở sản xuất, kinh doanh mới thành lập, có phương án sản xuất,
kinh doanh tổ chức sản xuất khép kín, hạch toán tập trung và sử dụng sản phẩm
thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT để sản xuất ra mặt hàng chịu thuế GTGT
nhưng trong giai đoạn đầu tư xây dựng cơ bản có cung cấp hàng hóa, dịch vụ
không chịu thuế GTGT thì số thuế GTGT đầu vào trong giai đoạn đầu tư để hình
thành tài sản cố định được khấu trừ toàn bộ. Cơ sở kinh doanh phải hạch toán
riêng số thuế GTGT đầu vào không sử dụng cho đầu tư tài sản cố định phục vụ cho
hoạt động sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ không chịu thuế GTGT để kê khai
khấu trừ theo tỷ lệ (%) giữa doanh số chịu thuế GTGT so với tổng doanh số hàng
hóa, dịch vụ bán ra.
Đối với
cơ sở kinh doanh có dự án đầu tư để tiếp tục sản xuất, chế biến và có văn bản
cam kết tiếp tục sản xuất sản phẩm chịu thuế GTGT thì được kê khai, khấu trừ
thuế GTGT ngay từ giai đoạn đầu tư xây dựng cơ bản. Đối với thuế GTGT đầu vào
phát sinh trong giai đoạn đầu tư XDCB, doanh nghiệp đã kê khai, khấu trừ, hoàn
thuế nhưng sau đó xác định không đủ điều kiện, khấu trừ, hoàn thuế thì doanh
nghiệp phải kê khai, điều chỉnh nộp lại tiền thuế GTGT đã khấu trừ, hoàn thuế.
Trường hợp doanh nghiệp không thực hiện điều chỉnh, qua thanh tra, kiểm tra cơ
quan thuế phát hiện ra thì cơ quan thuế sẽ thực hiện truy thu, truy hoàn và xử
phạt theo quy định. Doanh nghiệp phải hoàn toàn chịu trách nhiệm trước pháp luật
về các nội dung đã báo cáo, cam kết giải trình với cơ quan thuế liên quan đến
việc khấu trừ, hoàn thuế.
Trường
hợp cơ sở có bán hàng hóa là sản phẩm nông, lâm, thủy hải sản chưa qua chế biến
hoặc mới qua sơ chế thông thường thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT thì số
thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào được tính khấu trừ theo tỷ lệ (%) doanh
số hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT so với tổng doanh số của hàng hóa, dịch vụ
bán ra.
- Đối với
cơ sở sản xuất kinh doanh có dự án đầu tư, bao gồm cả cơ sở sản xuất, kinh
doanh mới thành lập, vừa đầu tư vào sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ không
chịu thuế GTGT, vừa đầu tư vào sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế
GTGT thì số thuế GTGT đầu vào của tài sản cố định trong giai đoạn đầu tư xây dựng
cơ bản được tạm khấu trừ theo tỷ lệ (%) giữa doanh thu của hàng hóa, dịch vụ chịu
thuế GTGT so với tổng doanh thu của hàng hóa, dịch vụ bán ra theo phương án sản
xuất, kinh doanh của cơ sở kinh doanh. Số thuế tạm khấu trừ được điều chỉnh
theo tỷ lệ (%) giữa doanh thu của hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT so với tổng
doanh thu của hàng hóa, dịch vụ bán ra trong ba năm kể từ năm đầu tiên có doanh
thu.
5. Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa (kể cả hàng hóa mua ngoài hoặc hàng hóa do doanh nghiệp
tự sản xuất) mà doanh nghiệp sử dụng để cho, biếu, tặng, khuyến mại, quảng cáo
dưới các hình thức, phục vụ cho sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế
GTGT thì được khấu trừ.
6. Số
thuế GTGT đã nộp theo Quyết định ấn định thuế của cơ quan hải quan được khấu trừ
toàn bộ, trừ trường hợp cơ quan hải quan xử phạt về gian lận, trốn thuế.
7. Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch
vụ không chịu thuế GTGT hướng dẫn tại Điều 4 Thông tư này không được khấu trừ,
trừ các trường hợp sau:
a) Thuế
GTGT của hàng hóa, dịch vụ mà cơ sở kinh doanh mua vào để sản xuất kinh doanh
hàng hóa, dịch vụ cung cấp cho tổ chức, cá nhân nước ngoài, tổ chức quốc tế để
viện trợ nhân đạo, viện trợ không hoàn lại hướng dẫn tại khoản 19 Điều 4 Thông
tư này được khấu trừ toàn bộ;
b) Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho hoạt động tìm kiếm, thăm dò,
phát triển mỏ dầu khí đến ngày khai thác đầu tiên hoặc ngày sản xuất đầu tiên
được khấu trừ toàn bộ.
8. Thuế
GTGT đầu vào phát sinh trong kỳ nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế
phải nộp của kỳ đó, không phân biệt đã xuất dùng hay còn để trong kho.
Trường
hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế GTGT đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị
sai sót thì được kê khai, khấu trừ bổ sung trước khi cơ quan thuế, cơ quan có
thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế tại trụ sở người nộp
thuế.
9. Số
thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ, cơ sở kinh doanh được hạch toán vào chi
phí để tính thuế thu nhập doanh nghiệp hoặc tính vào nguyên giá
của tài sản cố định, trừ số thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào từng lần có
giá trị từ hai mươi triệu đồng trở lên không có chứng từ thanh toán không dùng
tiền mặt.
10. Văn
phòng Tổng công ty, tập đoàn không trực tiếp hoạt động kinh doanh và các đơn vị
hành chính sự nghiệp trực thuộc như: Bệnh viện, Trạm xá,
Nhà nghỉ điều dưỡng, Viện, Trường đào tạo... không phải là người nộp thuế GTGT
thì không được khấu trừ hay hoàn thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua
vào phục vụ cho hoạt động của các đơn vị này.
Trường
hợp các đơn vị này có hoạt động kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT thì
phải đăng ký, kê khai nộp thuế GTGT riêng cho các hoạt động này.
11. Thuế
GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho các hoạt động cung cấp hàng hóa,
dịch vụ không kê khai, tính nộp thuế GTGT hướng dẫn tại Điều 5 Thông tư này (trừ
khoản 2, khoản 3 Điều 5) được khấu trừ toàn bộ.
12. Cơ
sở kinh doanh được kê khai, khấu trừ thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào dưới
hình thức ủy quyền cho tổ chức, cá nhân khác mà hóa đơn mang tên tổ chức.
13. Trường
hợp cá nhân, tổ chức không kinh doanh có góp vốn bằng tài sản vào công ty trách
nhiệm hữu hạn, công ty cổ phần thì chứng từ đối với tài sản góp vốn là biên bản
chứng nhận góp vốn, biên bản giao nhận tài sản. Trường
hợp tài sản góp vốn là tài sản mới mua, chưa sử dụng, có hóa đơn hợp pháp được
hội đồng giao nhận vốn góp chấp nhận thì trị giá vốn góp được xác định theo trị
giá ghi trên hóa đơn bao gồm cả thuế GTGT; Bên nhận vốn góp được kê khai khấu
trừ thuế GTGT ghi trên hóa đơn mua tài sản của bên góp vốn.
14. Cơ
sở kinh doanh nộp thuế giá trị gia tăng theo phương pháp tính trực tiếp trên
giá trị gia tăng khi chuyển sang nộp thuế theo phương pháp khấu trừ thuếđược khấu
trừ thuế giá trị gia tăng của hàng hóa, dịch vụ mua vào phát sinh kể từ kỳ đầu
tiên kê khai, nộp thuế theo phương pháp khấu trừ thuế.
15. Cơ
sở kinh doanh không được tính khấu trừ thuế GTGT đầu vào đối với trường hợp:
- Hóa
đơn GTGT sử dụng không đúng quy định của pháp luật như: hóa đơn GTGT không ghi
thuế GTGT (trừ trường hợp đặc thù được dùng hóa đơn GTGT ghi giá thanh toán là
giá đã có thuế GTGT);
- Hóa
đơn không ghi hoặc ghi không đúng một trong các chỉ tiêu như tên, địa chỉ, mã số
thuế của người bán nên không xác định được người bán.
- Hóa
đơn không ghi hoặc ghi không đúng một trong các chỉ tiêu như tên, địa chỉ, mã số
thuế của người mua nên không xác định được người mua.
- Hóa
đơn, chứng từ nộp thuế GTGT giả, hóa đơn bị tẩy xóa, hóa đơn khống (không có
hàng hóa, dịch vụ kèm theo);
- Hóa
đơn ghi giá trị không đúng giá trị thực tế của hàng hóa, dịch vụ mua, bán hoặc
trao đổi.
Biểu thuế lũy tiến từng phần